題目：基因組大數據輔助解析小麥條銹菌群體演化規律

主講：賀飛 研究員

時間：12月23日（周一）15:00

地點：登高樓一樓學術報告廳

主講人簡介: 

賀飛，中科院遺傳與發育生物學研究所研究員，中科院-英國約翰·英納斯中心（JIC）植物和微生物聯合研究中心（CEPAMS）課題組組長。本科畢業于西南大學農學與生命科學學院，2011年在中國農業大學生物學院獲得生物信息學博士學位，先后在美國斯隆凱特琳癌癥中心、布魯克海文國家實驗室、堪薩斯州立大學從事博士后研究。長期從事生物信息學與農作物基因組學研究。2021年建立課題組以來，致力于利用基因組學解析小麥抗病育種的進化機制。

報告簡介：

隨著高通量測序技術的普及，越來越多的小麥條銹菌基因組被測序。公共數據庫中目前已經積累了數百份條銹菌的高通量測序數據。這些數據來自世界各地的實驗室、針對不同的菌株、有著不同的實驗設計與研究目的。我們對這些數據進行了整合，獲得了一張高密度SNP的遺傳多樣性圖譜。利用該圖譜，我們不僅觀察到了有性生殖的廣泛痕跡，還觀察到部分基因組區域存在重組被抑制的現象。結合比較基因組學分析，我們發現條銹菌基因組的雜合度并非是長期無性繁殖的結果，而是由于核單倍型之間差異造成。所以，公共數據的整合分析能夠揭示小麥條銹菌的基因組演化規律。這些規律是否可以幫助定位無毒基因有待進一步探索。

                歡迎廣大師生參加！

組織單位：農學院