報告題目:面向異構(gòu)計算平臺的高性能大規(guī)模生物序列分析算法關(guān)鍵技術(shù)研究
報 告 人:劉衛(wèi)國 教授
報告時間:3月14日(周三)14:30
報告地點:文理大樓804
報告人簡介:
劉衛(wèi)國,教授,博士生導(dǎo)師,山東省泰山學(xué)者,擔(dān)任山東大學(xué)計算機(jī)學(xué)院高性能計算與大數(shù)據(jù)處理學(xué)科組負(fù)責(zé)人。主要研究領(lǐng)域為異構(gòu)高性能計算、生物信息學(xué)、大數(shù)據(jù)處理。在高水平國際期刊如IEEE TPDS, IEEE TITB, JCB, PRL, CPC, BMC Bioinformatics和著名國際會議如SC, IPDPS, ICPP, BIBM,EuroPar, Cluster, HiPC上發(fā)表學(xué)術(shù)論文50余篇。擔(dān)任多個國際期刊審稿人和國際會議程序委員會委員。其科研成果兩次獲得德國Fraunhofer IGD的最佳論文一等獎,2016 CCF高性能計算學(xué)術(shù)會議最佳論文獎,2017年“戈登?貝爾”獎。目前是中國計算機(jī)學(xué)會會員,高性能計算專業(yè)委員會委員,生物信息專業(yè)組委員。
報告摘要:
近年來異構(gòu)計算平臺被廣泛應(yīng)用于解決生物序列數(shù)據(jù)分析問題,然而已有的工作缺乏針對不同處理器的通用性;此外大多數(shù)工作主要集中在針對小規(guī)模數(shù)據(jù)的簡單并行算法設(shè)計,缺乏對異構(gòu)平臺上不同處理器之間如何協(xié)同計算進(jìn)而解決大規(guī)模生物序列數(shù)據(jù)分析問題的深入探討;并且現(xiàn)有的工作缺少針對異構(gòu)超級計算平臺上算法規(guī)模擴(kuò)展性的深入研究。本報告圍繞上述問題,研究基于異構(gòu)計算平臺上的通用可擴(kuò)展大規(guī)模生物序列分析算法設(shè)計理論和方法,研究成果將為大規(guī)模高性能生物序列數(shù)據(jù)分析的學(xué)術(shù)研究與技術(shù)應(yīng)用打下重要基礎(chǔ)。








