山東農(nóng)業(yè)大學(xué)是一所具有百年歷史的名校。其前身是1906年（清光緒32年）創(chuàng)辦于濟南的山東高等農(nóng)業(yè)學(xué)堂。1913年改名為山東公立農(nóng)業(yè)專門學(xué)校。1926年，公立農(nóng)專與其他五所專門學(xué)校合并，成立了省立山東大學(xué)，其中公立農(nóng)專成為省立山東大學(xué)農(nóng)學(xué)院。1928年改為國立山東大學(xué)農(nóng)學(xué)院，遷址青島。1937年因抗戰(zhàn)爆發(fā)，學(xué)校由青島遷四川萬縣辦學(xué)，1946年遷回青島復(fù)校。當時的山東大學(xué)農(nóng)學(xué)院設(shè)農(nóng)藝、園藝、水產(chǎn)三個系及一個農(nóng)場。同一時期，1947年山東省立農(nóng)學(xué)院在濟南原公立農(nóng)專舊址宣告成立，設(shè)有農(nóng)藝、園藝、森林、農(nóng)業(yè)經(jīng)濟四個系，后改名為山東農(nóng)學(xué)院。1952年10月，根據(jù)國家教育部關(guān)于院系調(diào)整的意見，山東省立農(nóng)學(xué)院與當時的山東大學(xué)農(nóng)學(xué)院合并，同時調(diào)入齊魯大學(xué)農(nóng)業(yè)專科、金陵大學(xué)園藝系、南京大學(xué)園藝系果樹組，組成了新的山東農(nóng)學(xué)院，校址在濟南。新的農(nóng)學(xué)院匯集了陳瑞泰、李家文、丁巨波、王清和等一大批國內(nèi)外知名的專家教授，經(jīng)他們數(shù)十年不懈的努力，為學(xué)院和學(xué)科的發(fā)展建設(shè)奠定了堅實的基礎(chǔ)。1958年，學(xué)校遷址泰安，由山東農(nóng)學(xué)院、山東林學(xué)院、山東畜牧獸醫(yī)學(xué)院、泰安農(nóng)業(yè)專科學(xué)校、泰安水利學(xué)校合并建立山東農(nóng)業(yè)大學(xué)，1959年改稱山東農(nóng)學(xué)院。此后幾十年，雖然也有過一些調(diào)整，但學(xué)校的主體沒有大的變動。1983年9月，經(jīng)教育部和山東省人民政府批準，山東農(nóng)學(xué)院改名為山東農(nóng)業(yè)大學(xué)。
1999年7月，經(jīng)山東省人民政府批準，將山東農(nóng)業(yè)大學(xué)、山東水利專科學(xué)校合并，同時將山東省林業(yè)學(xué)校并入，組建新的山東農(nóng)業(yè)大學(xué)。
山東水利專科學(xué)校的前身是創(chuàng)建于1955年的山東省濟南水利學(xué)校，1958年校址遷至泰安，同年10月與山東農(nóng)業(yè)大學(xué)合并，改為山東農(nóng)業(yè)大學(xué)水利系。1959年與山東農(nóng)業(yè)大學(xué)分開，12月改為山東省泰安水利學(xué)校。1984年6月經(jīng)教育部批準，改建為山東水利專科學(xué)校。經(jīng)過四十多年的建設(shè)發(fā)展，至1999年12月合校前，學(xué)校有教職工423人，其中教授10人，副教授、副研究員50人，全日制在校生2,489人。學(xué)校設(shè)有水利工程系、水資源系、建筑工程系等3個系，社科部、基礎(chǔ)部2個教學(xué)部和水利工程、水資源與水文、房屋建筑工程等15個專業(yè)。是教育部確定的全國30所示范性高等工程專科重點建設(shè)學(xué)校之一。建校以來，共培養(yǎng)大中專畢業(yè)生1萬余人，培訓(xùn)各類在職人員7000余人。
山東省林業(yè)學(xué)校創(chuàng)建于1952年，是全國建校最早的五所中等林業(yè)學(xué)校之一，校址位于泰安縣北關(guān)玉皇閣。至合校前的47年中，學(xué)校曾六易其名，先后為：林業(yè)部泰安中等林業(yè)學(xué)校、山東省泰安林業(yè)學(xué)校、山東省泰山林業(yè)學(xué)校、山東林學(xué)院、山東農(nóng)業(yè)大學(xué)中專部、山東省林業(yè)學(xué)校。學(xué)校占地208畝，分南北兩院，校舍建筑面積65,093平方米。教學(xué)實驗實習條件優(yōu)越，80畝的樹木標本園有木本植物498種，草本植物312種，有實驗林場20,000余畝，木材蓄積量7萬立方米。截止合校前，學(xué)校有教職工341人，其中高級講師39人，講師69人。學(xué)校設(shè)有林業(yè)、森林保護、經(jīng)濟林、桑蠶等4個專業(yè)，其中林業(yè)、森林保護為國家重點專業(yè)。建校以來，共為國家培養(yǎng)大中專畢業(yè)生5,360余人，培訓(xùn)在職干部5,570余人、農(nóng)民林果技術(shù)員1,300余人。
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