近日，植物保護學院楊龍教授團隊在International Journal of Molecular Sciences上發表了題為CRISPR/Cas9 Editing Sites Identification and Multi-Elements Association Analysis inCamellia sinensis的論文。

CRISPR/Cas9是一種高效的基因組編輯工具，茶樹基因組中編輯位點的鑒定及潛在影響因素尚未得到研究。在本研究中，利用生物信息學方法鑒定shuchazao基因組中包括編輯位點、simple sequence repeats (SSR)、G-四鏈體、基因密度的特征及其關系。在基因組中共鑒定了248,134,838個潛在的編輯位點，觀察到AGG、TGG、CGG、GGG、NGG五種PAM類型，其中66,665,912個被發現是有特異性的，它們存在于基因所有結構元件中。聯合分析中在染色體中發現了GC含量、GQ密度、PAM密度高相反基因密度、SSR密度低的特征區域，并發現該區域與次生代謝物和氨基酸生物合成途徑相關。所鑒定的編輯位點與影響元件SSR標記為茶樹功能研究和分子育種提供了有價值的工具，也給予了其他作物育種參考。

山東農業大學植物保護學院22級碩士研究生李浩真與博士生宋康康為文章共同第一作者，山東農業大學植物保護學院楊龍教授為論文通訊作者。本研究得到了山東省現代農業產業技術體系創新團隊項目和中央引導地方科技發展資金的資助。

論文鏈接：https://www.mdpi.com/1422-0067/24/20/15317

編      輯：萬    千 

審      核：賈    波